一種基于GPU加速的化學結構多樣性分析方法,包括:(a)讀取存儲設備中的查詢庫和被查詢庫中的化學結構連接表數據到主存儲器;(b)將該數據分別分解為查詢庫和被查詢庫的化學環境編碼的樹狀拓撲子圖集,并存儲在主存儲器中;(c)將查詢庫和被查詢庫的化學環境編碼的樹狀拓撲子圖集分別與樹狀拓撲子圖模板進行比較,以分別生成查詢庫和被查詢庫的二進制數據,并存儲在主存儲器中;(d)將查詢庫和被查詢庫的二進制數據從主存儲器傳輸至幀緩存;(e)GPU從該幀緩存中讀取該查詢庫和被查詢庫的二進制數據,并計算兩者的相似度值;(f)將相似度值由幀緩存傳輸至主存儲器中;(g)CPU從主存儲器中讀取相似度值,并輸出至存儲設備。
聲明:
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